本溪市动物卫生监督管理局设7个处室，即动物卫生监督管理处、动物疫病控制处、畜产品安全处(市饲料工作办公室)、兽医医政与科教处、畜牧生产与草业处、办公室和机关党总支，辖动物疫病预防控制中心、动物检疫站和畜禽良种研究推广中心等三个事业单位。
工作职责
动物卫生监督管理处
负责组织实施动物卫生行政执法；制定辖区内动物疫病的监控规划和计划，监督管理行政区域内动物防疫、检疫工作；组织对动物疫情的扑灭；负责动物病原微生物的安全监督管理；承担上级动物卫生监督管理机构交办的其他事项。
动物疫病控制处
负责全市动物疫病预防、动物及动物产品的产地检疫和兽医公共卫生管理工作；负责重大动物疫病的综合防治工作，拟定动物传染病和兽医公共卫生防治规划及措施；对突发重大动物疫病实施紧急处置；负责市防治重大动物疫病指挥部办公室的日常工作。
畜产品安全处(市饲料工作办公室)
拟定饲料、兽药和无公害动物产品发展规划和计划，负责饲料、兽药的研制、生产、经营、使用的监督管理；组织实施无公害畜产品产地、产品的认证和质量监督管理工作。
兽医医政与科教处
负责全市兽医执业人员和兽医执业单位的管理；组织动物医疗事故的技术鉴定；负责全市兽医行风建设；拟定全市动物卫生科技、教育、标准规划和计划；组织实施动物卫生技术示范工程；负责动物卫生科技成果管理和动物卫生系统专业技术人员的在职培训和继续教育。
畜牧生产与草业处
贯彻执行关于畜牧和草业工作的方针、政策及有关法律法规；制定和实施畜牧、草业发展规划和计划；组织推进饲养方式的转变及畜牧业产业化工作；实施畜牧、草业基本建设项目；组织草地资源保护、建设、利用和管理工作；组织种畜禽繁育体系建设和地方畜禽良种资源保护及种畜禽引进输出的相关工作。
办公室
协助领导协调和处理政务工作和机关日常工作；负责综合性文件的起草和有关会议的组织工作；负责机关文秘、档案、提案议案处理、督察、信访、信息、保密、保卫等工作；负责机关及直属单位的党群、人事、劳资、计划生育等工作；负责制订市本级动物卫生财政专项资金计划并对计划执行情况进行监督检查，管理财政专项资金；负责机关财务管理；负责直属单位内部审计和国有资产管理；负责机关老干部工作。
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