市交通局设9个职能处（室）：办公室、人事劳动教育处、计划财务处、法规处、海事处（技术安全处）、组织部、宣传部、监察处、离退休干部处。
　　办公室
　　一、负责局机关工作的组织协调和工作接待；
　　二、负责交通工作的综合调研、重要报告和综合性文件的起草，重大会议的会务工作；
　　三、负责政务信息、文电处理、保密、信访、档案、建议与提案办理、社会治安综合治理、计划生育等工作；
　　四、负责机关行政事务管理和后勤管理工作。
　　人事劳动教育处
　　一、负责局属各单位人事、劳动工资、机构编制管理工作；
　　二、负责局属各单位一般干部、专业技术人员、工人的培训、考核、任免、奖惩、工资晋升、调配的宏观管理工作；
　　三、负责人才引进、人才交流及军转干部、复员军人的安置工作；
　　四、负责局属各单位各种保险金交纳使用的监督指导；
　　五、负责交通行业中等教育、职业教育和从业人员培训工作的综合管理；
　　六、负责交通行业中级以下工程技术人员职称评审工作。
　　计划财务处
　　一、负责全市公路、水路基础设施建设中长期规划及年度计划的起草并监督实施；
　　二、负责交通行业统计、预测、信息引导工作等；
　　三、负责制定交通行业财务、会计报表、财务决算及全市公路通行费等专项基金的管理；
　　四、负责交通建设资金的筹集、使用和监督；
　　五、负责公路、水路、运输和收费项目的管理；
　　六、负责交通专项资金审计计划监督，指导交通系统审计工作；
　　七、负责交通行业涉外工作、开展公路国际经济技术交流和合作。
　　法规处
　　一、指导全市交通行业体制改革和法制建设工作；
　　二、负责交通行政执法监督和行政复议工作；
　　三、负责交通法规、规章和规范性文件的规划研究、起草和立法协调工作；
　　四、负责交通行政执法人员培训、考核和执法资格的管理；
　　五、负责年度工作目标的拟定、审核及兑现工作。
　　海事处（技术安全处）
　　一、负责交通行业科技规划的制定与实施；
　　二、负责交通系统安全生产的综合管理；
　　三、负责全市水上航道设施的规划、建设与维护的行业管理与监督；
　　四、负责水上交通安全监督，防止船舶污染；
　　五、负责全市运输船舶、水上设施检验和修、造运输船舶行业的监督管理；
　　六、负责全市船舶运输、水上辅助行业管理和监督。
　　组织部
　　一、负责全系统党的基层组织建设；
　　二、负责全系统领导班子建设；
　　三、负责全系统干部队伍的宏观管理；
　　四、负责全系统知识分子工作的宏观管理；
　　五、负责指导全系统党的基层组织部门建设；
　　六、上级部门和领导交办的其他工作。
　　宣传部
　　一、负责指导全系统的理论学习工作；
　　二、负责全系统的精神文明建设工作；
　　三、负责全系统的法制宣传教育工作；
　　四、负责事业单位政工人员职称评定工作；
　　五、负责全系统的统战、侨务、民族团结工作；
　　六、负责新闻报道工作；
　　七、上级和领导交办的临时性工作。
　 监察处
　　一、贯彻执行党的路线、方针和政策，落实党风廉政建设责任制，抓好本系统党风廉政建设和反腐败斗争工作任务。
　　二、开展交通系统反腐败源头治理工作。
　　三、组织开展执法监察和效能监察工作。
　　四、组织开展本系统党风廉政建设和反腐败斗争的宣传教育、综合调研和信息上报工作。
　　五、协助做好本系统的纪检干部管理和培训工作。
　　六、抓好两级领导干部廉洁自律工作。
　　七、处理来信来访和案件查办工作。
　　八、纠正交通行业不正之风。
　　九、完成上级交办的其它工作。
　 离退休干部处
　 一、负责离退休干部的管理工作；
　 二、监管离退休干部公用经费使用。