一、党政综合办公室
主要职能任务：负责开发区政务督办工作；文秘工作；后勤工作；人大工作；法制工作；公共突发事件应急管理工作；群众团体工作。
二、招商局
主要职能任务：负责开发区招商引资工作的协调、调度、管理工作；开发区各项优惠政策的研究、制定工作；开发区招商引资对外宣传和信息管理工作；开发区涉外事务工作；开发区招商引资有关的资信考察、投资风险评估工作；开发区投资服务中心管理工作。
三、财政局
主要职能任务：负责开发区财政管理；国有资产监督管理；机关事业单位财务核算工作；政府采购工作；开发区中小企业信用担保工作。
四、经济技术发展局
主要职能任务：负责开发区经济和社会发展规划、计划的制定工作；开发区各项政策、规章研究制定的协调、综合工作；开发区安商、亲商的协调服务工作；开发区产业结构规划调整、发展促进、协调服务工作；开发区统计工作；开发区科技进步管理服务工作；开发区物价管理工作；开发区安全生产工作；开发区中小企业孵化管理工作；国家火炬计划本溪中药科技产业基地管理工作。
五、规划建设管理局（与综合执法局合署办公）
主要职能任务：负责开发区建设行业管理；规划管理；环境保护监督管理；工程质量安全监督管理；城镇绿化、设施、环卫管理；村镇房产管理；综合执法；土地储备工作。
六、劳动人事监察局（与编委办公室合署办公）
主要职能任务：负责开发区党政机关、事业单位组织、干部人事管理工作；统战工作；工资福利管理工作；机构编制管理工作；开发区企事业单位劳动和社会保障管理工作；劳动信访仲裁工作；就业服务工作；企业离退休职工管理服务工作；行政纪律监察工作；财务审计工作。
七、农业与社会事业管理局
主要职能任务：负责开发区农业工作；林业工作；水利水资源工作；动物卫生监督管理工作；信访工作；民政工作；文化工作；教育工作；卫生工作；计划生育工作；体育工作；爱国卫生运动。
八、信息中心（管委会直属事业单位）
主要职能任务：负责开发区的宣传工作；网络建设、维护及信息的管理、传递等工作。
九、中小企业孵化管理办公室
主要职能任务:承担园区开发建设和运营管理;主要负责孵化园运行各阶段产业政策的研究和利用;负责搭建各种中介服务和孵化平台;负责开发建设初期市场定位调研、规划设计意见提出及审核，建设期间项目融资管理、开发建设管理、招商引资管理及后期物业管理。下设辽宁药都发展有限公司，主要负责园区开发建设的资金融通以及企业化和市场化运作。
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